最为重要的纯洁内部还是毛泽东专列的纯洁。为此，滕代远提出参加专列工作的一切人员必须是政治上绝对可靠的“清一色”的党员、团员，不许留一个嫌疑犯或可疑分子。
沿线各站值班人员的纯洁也非常重要，为此，铁道部命令各个地方铁路部门党委，要对各站有关专列的值班人员进行逐个审查，以保证绝对可靠。
其次是整顿设备。这主要包括两个方面：一个方面是对专列的保护和检修。专用列车的全面检修，由北京铁路局负责逐辆彻底检查，并请解放军派工兵用雷达扫描检查有无易炸易燃物品。
另一个方面是检查完成之后，专列实行封闭管理，派军队警卫，不准任何人随便出入。凡上车人员，必须一律持“特许证”，经验证后方准上车。
再次是铁路和沿线的检查和警卫。从北京，经天津，再到满洲里，这段路路面很长，大小桥梁、隧道很多，而且当时正值冬季，东北地区到处都被大雪覆盖。铁轨上自然不会有雪，但是铁轨两侧积雪很厚，非常容易被破坏分子埋上地雷等爆炸物。
很明显，这个问题是铁道部门一个单位无法胜任的。为此，铁道部门邀请地方驻军加强沿路的警卫工作，并派出巡逻部队沿线加强巡视。
最后，在运输调度上，为预防一切事故，在专车未通过前，停开一切客货列车，如在沿线可就近入站待避，专车开过之后再重新编组发放。