后来，FBI通过对约翰·卡尔的DNA检测发现，他的DNA与犯罪现场所遗留的血迹中的DNA不相符，从而排除他是凶手的可能。可检控方却不那么认为，因为他们在抓捕卡尔时发现，他的私人电脑中有很多儿童色情图片。因此，他们以涉嫌传播儿童色情图片的罪名再次起诉约翰·卡尔。
可是，当约翰·卡尔有可能作为儿童性侵犯嫌疑人接受审讯时，案情又出现了戏剧性的转折：公诉方不小心将卡尔电脑中的关键数据弄丢了。结果，只好将约翰·卡尔当庭释放。对此，美国民众认为，约翰·卡尔曾声称在琼贝妮特遇害时与她在一起，很可能是他一厢情愿的幻想。这起轰动美国的幼女谋杀案至今仍是一大悬案。
【凶手的笔迹】
在大多数案件中，调查人员会在调查的过程中让笔迹分析专家对犯罪嫌疑人的笔迹进行分析。不管犯罪分子是出于威胁、索取钱财等原因留下笔迹，还是在被捕之后的书面坦白，都会由笔迹专家对其进行分析，以此帮助调查人员掌握有利的线索。因此，从根本上来说，笔迹学是一门取证科学。正如英国著名笔迹学家帕特里夏·马恩曾在其著作《罪犯笔迹》所说的那样：“没有笔迹学家能够根据一两个显而易见的线索发现一个人是罪犯，正如同医生无法在发现一个迹象后就诊断出病人身上的病症。”